自序卷上绪论章第一六法兼施章第二脉诀章第三处方章第四家庭医案章第五卷下悬壶医案章第六药性裁成章第七方诀无隐章第八三子养亲汤霞天膏鹿丸斑龙宴内鹿髓丸外鹿髓丸黄鹤丹青囊丸天一丸异类有情丸女金丹驻阳小丹炼法
例言张聿青先生传卷一中风风温卷二湿温温疫说（补）卷三伏暑疟诸寒热霍乱丹痧卷四虚损内伤劳倦卷五咳嗽肺痿肺痈喘卷六吐血衄血蓄血便血溲血卷七痰饮痰湿痰气气郁卷八肝火肝阳肝风眩晕痉厥痰火卷九头痛脘痛胸胁痛腹痛
卷一经候门经闭痛经潮热、蒸热、寒热鼻衄带下崩漏阴肿门卷二种子门卷三胎前门恶阻胎动不安漏胎心腹胀满
余无言医案及医话
卷上勿药须知疗心法言林鉴堂安心诗养心说养肝说养脾说养肺说养肾说斋说食忌说食饮以宜居室安处论居处宜忌说寝室宜忌说卧时祝法睡诀孙真人卫生歌真西山卫生歌养神气铭孙真人养生铭谨疾箴导引却病法内养下手诀运气法固
前序序石山先生自赞卷一痈疽脉一治疮脉诀七恶五善二诸恶疮五逆三定痈死地分四背上九处不可病痈五痈发有不可治六发背治之难易七占色候生死八痈之源有五九生痈所感不同十肺肝肾痈症十一痈生原于脏腑十二辨脏腑内疮十三
风劳臌膈四大证治
明目论看眼诀图眼病歌诀冷眼歌诀热眼歌诀药性光明赋五经虚泻五经火眼目虚实冷热论点药药性炮炼法男女禁忌看眼法演药法点药法制药法煎膏法研药法合药法用药法服药法禁忌主药方辅药方加减方按五轮治疗捷法四季加减煎药
《续编》序卷上赤石脂栝楼根蜀漆生姜卷下桃仁巴豆蜜虫虻虫阿胶粳米小麦大麦粉赤小豆胶饴酒醇酒清酒法醋苦酒美酒酰白酒浆水清浆水白饮饮暖水沸汤麻沸汤鸡子白鸡子黄鸡屎白马通汁猪膏猪脂猪肤猪胆獭肝羊胆羊肉蜘蛛蛴螬
张序卷之上一、天地六位脏象图（图缺）二、手足阴阳（一）手足三阴三阳（二）手三阴三阳（三）足三阴三阳三、五脏六腑，除心包络十一经脉证法（一）肝之经，肝脉本部在于筋，足厥阴，风，乙木也。（二）胆之经，足少