序凡例原叙卷首诊法五脏六腑经气望色闻声问证切脉卷一证治背上头骨两耳眼目唇口鼻孔齿牙舌本咽喉胸前大腹小腹胁肋腰中手臂脚腿前阴后阴大便小便卷二证治寒热呕吐咳嗽喘失血遗精言语心神斑黄出汗肿胀饮食起居倒仆掣动
原序附刊丹方补遗序自序凡例贸药辨真假诸症歌诀单方经验丹方汇编中风预防中风风气痛（附痿症、脱颏）虚劳血证肿胀反胃噎膈痰饮咳嗽梦遗白浊伤寒瘟疫（附冒风寒方）疟疾痢疾肠风下血便血淋漓并小便闭塞霍乱吐泻（附痧
林序皇甫序序例卷一精神五脏论第一五脏变第二五脏六腑阴阳表里第三五脏六腑官第四五脏大小六腑应候第五十二原第六十二经水第七四海第八气息周身五十营四时十分漏刻第九营气第十营卫三焦第十一阴阳清浊精气津液血脉第
卷之一要书说六经图足太阳膀胱经手小肠足阳明胃经手大肠足卲阳胆经手三焦足太阴脾经手肺足少阴肾经手心足厥阴肝经手心胞伤寒纲领伤寒论伤寒标本表里虚实发表之药用温攻里之药用寒温里之药用热论十六种治法一 伤寒二
仁端录
《本草衍义》提要序卷一序例上衍义总叙卷二序例中卷三序例下内容卷四玉泉丹砂空青绿青云母石钟乳朴硝芒硝硝石英硝矾石滑石紫石英白石英赤石脂白石脂石中黄子婆娑石无名异菩萨石卷五金屑银屑水银水银粉雄黄雌黄石硫黄
序刻脉症治方序刻脉症治方小言脉症治方凡例卷之一风门（中风瘫痪疠风惊风附 伤风）中风（附瘫痪疠风惊风）伤风卷之一寒门（伤寒 中寒 瘟疫大头病附 内伤脾胃附）伤寒中寒温疫（大头病附）内伤（脾胃附）卷之二暑
串雅内外编
药性歌括四百味
序自叙卷一朝廷对于医者之医方卷二世界对于医者之医方卷三医者自医之医方