叙卷上卷上一卷上二卷上三卷上四卷上五卷上六卷下卷下一卷下二卷下三卷下四卷下五
原序附刊丹方补遗序自序凡例贸药辨真假诸症歌诀单方经验丹方汇编中风预防中风风气痛（附痿症、脱颏）虚劳血证肿胀反胃噎膈痰饮咳嗽梦遗白浊伤寒瘟疫（附冒风寒方）疟疾痢疾肠风下血便血淋漓并小便闭塞霍乱吐泻（附痧
陆序姚序例言卷一卷二卷三附刊书札跋
通俗序壶天性果女丹十则（一卷）第一则·养真化气第二则·九转炼形第三则·运用火符第四则·默运胎息第五则·广立功行第六则·志坚行持第七则·调养元神第八则·移神出壳第九则·待度飞升第十则·了道成真女金丹序上
伤寒杂病论序伤寒论序自序后序卷首·仲景微旨 九章寒温异气传经大凡解期早晚寒热死生营卫殊病六经分篇六气司令一气独胜篇章次第卷一·脉法上篇 三十一章脉法上篇提纲脉法一脉法二脉法三脉法四脉法五脉法六脉法七脉
自序凡例卷一阴阳水火气血论男女异同论脏腑病机论脉证死生论用药宜忌论本书补救论卷二吐血呕血咯血唾血咳血鼻衄脑衄目衄耳衄齿衄舌衄大衄零腥吐脓卷三汗血血箭血痣血瘙疮血创血跌打血卷四便血便脓尿血经血崩带产血卷
祝由十三科
简介序凡例卷一卷二卷三卷四卷五卷六
序卷一跌打损伤小引看伤有治无治之论秘传下手口诀治周身口诀损伤秘传口诀秘传接骨口诀效方开后秘传要旨总论秘传损方药名十二咏卷二总论卷三跌打水药歌观音针（一点一针）雷火针九龙针太乙救苦针又麻药方附录经验杂方
小引卷一水部诸水火部诸火土部诸土金部金赤铜铜青自然铜古文钱铅铅粉铅丹密陀僧锡铁落针砂铁精铁锈石部玉云母白石英紫石英丹砂银朱水银轻粉灵砂雄黄雌黄石膏滑石赤石脂炉甘石无名异石钟乳锻石浮石阳起石磁石代赭石禹